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苏氨酸蛋白酶
编辑苏氨酸蛋白酶是一个蛋白水解酶家族,在活性位点内含有苏氨酸(Thr)残基。这类酶的原型成员是蛋白酶体的催化亚基,但酰基转移酶会聚进化出相同的活性位点几何结构和机制。
苏氨酸蛋白酶的机制
编辑苏氨酸蛋白酶使用其N端苏氨酸的仲醇作为亲核试剂进行催化。苏氨酸必须是N末端,因为相同残基的末端胺通过极化有序水而起到一般碱的作用,从而使醇去质子化以增加其作为亲核试剂的反应性。
催化分两步进行:
- 首先亲核试剂攻击底物形成共价酰基酶中间体,释放xxx个产物。
- 其次,中间体被水水解以再生游离酶并释放第二产物。
- 在鸟氨酸酰基转移酶中,底物鸟氨酸(受体)代替水进行第二次亲核攻击,因此与酰基一起离开。
苏氨酸蛋白酶的分类与演化
编辑苏氨酸蛋白酶向相同N端活性位点组织的进化收敛。显示的是蛋白酶体(PB族,T1族)和鸟氨酸乙酰转移酶(PE族,T5族)的催化苏氨酸。另见:催化三联体
目前已识别出属于两个独立超家族的五个家族:Ntn折叠蛋白体(超家族PB)和DOM折叠鸟氨酸酰基转移酶(超家族PE)。这两个超家族代表了同一活动位点的两个独立的、趋同的演化。
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