金属蛋白酶

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金属蛋白酶,是任何蛋白酶的酶,其催化机制包括金属。这方面的一个例子是ADAM12,它在胚胎发育过程中的肌肉细胞融合中发挥重要作用,这一过程称为肌生成。 大多数金属蛋白酶需要锌,但有些使用钴。金属离子通过三个配体与蛋白质配位。配位金属离子的配体可随组氨酸、谷氨酸、天冬氨酸、赖氨酸和精氨酸而变化。第四个配位位置由不稳定的水分子占据。 用螯合剂如EDTA处理会导致完全失活。EDTA是一种金属螯合剂,可去...

金属蛋白酶

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金属蛋白酶,是任何蛋白酶的酶,其催化机制包括金属。这方面的一个例子是ADAM12,它在胚胎发育过程中的肌肉细胞融合中发挥重要作用,这一过程称为肌生成。

大多数金属蛋白酶需要锌,但有些使用钴。金属离子通过三个配体蛋白质配位。配位金属离子的配体可随组氨酸谷氨酸、天冬氨酸、赖氨酸和精氨酸而变化。第四个配位位置由不稳定的水分子占据。

用螯合剂如EDTA处理会导致完全失活。EDTA是一种金属螯合剂,可去除对活性至关重要的锌。它们也被螯合剂邻菲咯啉抑制。

金属蛋白酶的分类

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金属蛋白酶有两个亚组:

  • 外肽酶、金属外肽酶(EC编号:3.4.17)。
  • 内肽酶、金属内肽酶(3.4.24)。众所周知的金属内肽酶包括ADAM蛋白和基质金属蛋白酶,以及M16金属蛋白酶,如胰岛素降解酶和前序蛋白酶

在MEROPS数据库中,肽酶家族按其催化类型分组,xxx个字符代表催化类型:A,天冬氨酸;C、半胱氨酸;G、谷氨酸;M,金属;S,丝氨酸;T,苏氨酸;和U,未知。丝氨酸、苏氨酸和半胱氨酸肽酶利用氨基酸作为亲核试剂并形成酰基中间体——这些肽酶也可以很容易地充当转移酶。在天冬氨酸、谷氨酸和金属肽酶的情况下,亲核试剂是活化的水分子。在许多情况下,结构蛋白折叠家族或家族的特征可能已失去其催化活性,但仍保留其在蛋白质识别和结合方面的功能

金属蛋白酶

金属蛋白酶是四种主要蛋白酶类型中最多样化的,迄今已分类超过50个家族。在这些酶中,二价阳离子(通常是锌)激活水分子。金属离子由氨基酸配体固定,通常为三个。已知的金属配体是组氨酸、谷氨酸、天冬氨酸或赖氨酸,催化需要至少一种其他残基,其可起亲电作用。在已知的金属蛋白酶中,大约一半包含一个HEXXH基序,在晶体学研究中已显示其形成金属结合位点的一部分。HEXXH图案相对常见,但对于金属蛋白酶可以更严格地定义为“abXHEbbHbc”,其中“a”最常见的是缬氨酸或苏氨酸,并且是嗜热菌蛋白酶和脑啡肽酶中S1亚位点的一部分,“b”是不带电荷的残基,“c'一个疏水残基。该位点从未发现脯氨酸,可能是因为它会破坏金属蛋白酶中该基序采用的螺旋结构。

来自M48家族的金属肽酶是与内质网高尔基体相关的完整膜蛋白,每个亚基结合一个锌离子。这些内肽酶包括CAAX异戊二烯基蛋白酶1,其蛋白水解除去C末端三个残基的法呢基化的蛋白质。

金属蛋白酶抑制剂存在于许多海洋生物中,包括类、头足类动物、软体动物、藻类和细菌

M50金属肽酶家族的成员包括:哺动物甾醇调节元件结合蛋白(SREBP)位点2蛋白酶和大肠杆菌蛋白酶EcfE,IV阶段孢子形成蛋白FB。

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  1. 金属蛋白酶
  2. 金属蛋白酶的分类

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