保守性替换
编辑保守置换(也称为保守突变或保守置换)是蛋白质中的氨基酸置换,它将给定氨基酸改变为具有相似生化特性(例如电荷、疏水性和大小)的不同氨基酸。
相反,自由基取代或自由基取代是一种氨基酸取代,它用具有不同物理化学性质的最终氨基酸交换初始氨基酸。
描述
编辑有 20 种天然存在的氨基酸,但其中一些具有相似的特征。 例如,亮氨酸和异亮氨酸都是脂肪族支链疏水物。 同样,天冬氨酸和谷氨酸都是带负电荷的小残基。
尽管有多种氨基酸分类方法,但通常根据其结构和侧链(R 基团)的一般化学特征将它们分为六大类。
物理化学距离旨在根据氨基酸的可测量特性量化氨基酸之间的类内和类间差异,文献中提出了许多此类措施。 因此,保守置换是由小的物理化学距离分隔的两个氨基酸之间的交换。 相反,自由基置换是相隔较大物理化学距离的两个氨基酸之间的交换。
对功能的影响
编辑蛋白质中的保护性替代物通常比非保守替代物对功能有更好的影响。 保守替代对功能的影响降低也可以从自然界中不同替代的发生中看出。 蛋白质之间的非保守替换由于其有害作用,更有可能被自然选择去除。
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