费氏弧菌

费氏弓菌（也称为 Vibrio fischeri）是一种革兰氏阴性杆状细菌，广泛存在于海洋环境中。 该物种具有生物发光特性，主要与各种海洋动物共生，例如夏威夷短尾乌贼。 它是异养的、氧化酶阳性的，并且通过单极鞭毛运动。 自由生活的 A. fischeri 细胞靠腐烂的有机物生存。 该细菌是检查微生物生物发光、群体感应和细菌-动物共生的关键研究生物。 它以德国微生物学家 Bernhard Fischer 的名字命名。

核糖体 RNA 比较导致该物种在 2007 年从弧菌属重新分类为新创建的 Aliivibrio。然而，名称更改并未被大多数研究人员普遍接受，他们仍在发表 Vibrio fischeri（参见 2018-2019 年谷歌学术搜索）。

A. fischeri 的基因组于 2004 年完成测序，由两条染色体组成，一条较小，一条较大。 1 号染色体有 290 万个碱基对 (Mbp)，2 号染色体有 1.3 Mbp，使总基因组达到 4.2 Mbp。

A. fischeri 的 G+C 含量是 27 种弧菌中最低的，但仍与霍乱弧菌等高致病性物种关系最密切。 A. fischeri 的基因组也携带移动遗传元件。

A. fischeri 全球分布于温带和亚热带海洋环境中。 它们可以自由漂浮在海洋中，并且与海洋动物、沉积物和腐烂物质有关。 A. fischeri 作为海洋动物的共生体进行了最多的研究，包括 Euprymna 和 Sepiola 中的鱿鱼，其中 A. fischeri 可以在鱿鱼的发光器官中找到。 这种关系在夏威夷短尾乌贼 (Euprymna scolopes) 中得到了xxx的表征，其中 A. fischeri 是栖息在乌贼发光器官中的xxx细菌种类。

A. fischeri 对夏威夷短尾乌贼发光器官的定殖目前正在研究作为互利共生的简单模型，因为它只包含两个物种，A. fischeri 可以在实验室中培养并进行基因改造。 这种互利共生的功能主要是由于 A. fischeri 生物发光。 A. fischeri 占据了夏威夷短尾乌贼的发光器官并在夜间发光，为乌贼提供反光伪装，防止乌贼在海底投下阴影。

A. fischeri 定植发生在幼年鱿鱼中，并引起鱿鱼发光器官的形态变化。 有趣的是，当微生物不能发光时，A. fischeri 不会发生某些形态变化，这表明生物发光（如下所述）对于共生来说确实是必不可少的。 在定植过程中，动物发光体（发光器官）内的纤毛细胞选择性地吸收共生细菌。 这些细胞促进共生体的生长，并积极排斥任何竞争者。 一旦发光器官被充分定殖，细菌就会导致这些细胞死亡。

由于被称为反射蛋白的蛋白质，某些乌贼的发光器官含有反射板，可以增强和引导产生的光。 他们调节反照明伪装的光线，要求强度与上方海面的强度相匹配。 Sepiolid squid 每天早晨在称为排气的过程中排出其光器官中 90% 的共生细菌。 通风被认为提供了新孵化的鱿鱼被 A. fischeri 定殖的来源。

A. fischeri 的生物发光是由 lux 操纵子的转录引起的，它是通过种群依赖性群体感应诱导的。 A. fischeri 的种群需要达到最佳水平才能激活 lux 操纵子并刺激光的产生。 昼夜节律控制着光的表达，根据伪装的需要，白天的发光更亮，晚上更暗。

细菌荧光素-荧光素酶系统由一组标记为 lux 操纵子的基因编码。 在 A. fischeri 中，五个这样的基因 (luxCDABEG) 已被确定为活跃于可见光的发射，并且两个基因（luxR 和 luxI）参与调节操纵子。 一些外部和内部因素似乎会诱导或抑制该基因组的转录，并产生或抑制光发射。

A. fischeri 是许多通常与海洋生物形成共生关系的细菌之一。 海洋生物含有利用生物发光的细菌，因此它们可以寻找配偶、抵御捕食者、吸引猎物或与其他生物交流。 作为回报，细菌所在的生物体为细菌提供了营养丰富的环境。