比较基因组杂交

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比较基因组杂交 (CGH) 是一种分子细胞遗传学方法,用于分析与参考样本相比,测试样本 DNA 中倍性水平的拷贝数变异 (CNV),无需培养细胞。 该技术的目的是快速有效地比较来自两个来源的两个基因组 DNA 样本,这两个来源通常是密切相关的,因为怀疑它们在整个染色体或亚染色体区域的增益或丢失方面存在差异( 整个染色体的一部分)。 该技术最初是为评估实体瘤和正常组织的染色体互补物之间的差异而开...

比较基因组杂交

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比较基因组杂交 (CGH) 是一种分子细胞遗传学方法,用于分析与参考样本相比,测试样本 DNA 中倍性水平的拷贝数变异 (CNV),无需培养细胞。 该技术目的是快速有效地比较来自两个来源的两个基因组 DNA 样本,这两个来源通常是密切相关的,因为怀疑它们在整个染色体或亚染色体区域的增益或丢失方面存在差异( 整个染色体的一部分)。 该技术最初是为评估实体瘤和正常组织的染色体互补物之间的差异而开发的,与更传统的吉姆萨显带和荧光原位杂交 (FISH) 细胞遗传学分析技术相比,分辨率提高了 5-10 兆碱基 ) 受所用显微镜分辨率的限制。

这是通过使用竞争性荧光原位杂交实现的。 简而言之,这涉及从要比较的两个来源中分离 DNA,最常见的是测试和参考来源,用不同颜色(通常是红色和绿色)的荧光团(荧光分子)独立标记每个 DNA 样本,变性 DNA 使其成为单链,并将两个所得样本以 1:1 的比例杂交到染色体的正常中期扩散,标记的 DNA 样本将在其起源位点与其结合。 使用荧光显微镜计算机软件,然后沿着每条染色体的长度比较不同颜色的荧光信号,以识别两个来源之间的染色体差异。 染色体特定区域的测试样本颜色强度越高,表明相应源样本中该区域的物质增加,而参考样本颜色的强度越高,表明该特定区域的测试样本物质损失 地区。 中性颜色(当荧光团标签为红色和绿色时为黄色)表示该位置的两个样本之间没有差异。

CGH 只能检测平衡的染色体异常。 这是因为相互易位、倒位或环状染色体等平衡染色体异常不会影响拷贝数,而拷贝数是 CGH 技术检测到的。 然而,CGH 确实允许在单一测试中探索所有 46 条人类染色体并发现缺失和重复,甚至在微观尺度上,这可能导致识别候选基因,以通过其他细胞学技术进一步探索。

通过将 DNA 微阵列与 CGH 技术结合使用,已经开发出更具体形式的阵列 CGH (aCGH),允许对 CNV 进行逐个基因座测量,分辨率提高至 100 千碱基。 这种改进的技术允许发现已知和未知病症的病因。

历史

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CGH 发展的潜在动机源于这样一个事实,即当时可用的细胞遗传学分析形式的潜在分辨率受到解释其提供的结果所必需的显微镜的限制。 此外,giemsa 带解释有可能是模棱两可的,因此降低了可靠性,并且这两种技术都需要大量的劳动力投入,这限制了可以检查的位点。

 

比较基因组杂交

得出的结论是,获得的荧光比率是准确的,并且可以检测到来自不同细胞类型的基因组 DNA 之间的差异,因此 CGH 是一种非常有用的细胞遗传学分析工具

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