基因作图
编辑基础作图描述了用于识别基因座和基因间距离的方法。 基因作图还可以描述基因内不同位点之间的距离。
所有基因组作图的本质是将一组分子标记放置到它们在基因组上的各自位置上。 分子标记有各种形式。 在基因组图谱的构建中,基因可以被视为一种特殊类型的遗传标记,并以与任何其他标记相同的方式进行映射。 在某些研究领域,基因作图有助于在生物体内产生新的重组体。
遗传与生理
编辑基因组作图领域使用两种不同类型的图谱:遗传图谱和物理图谱。 虽然这两个图谱都是遗传标记和基因位点的集合,但遗传图谱的距离基于遗传连锁信息,而物理图谱使用通常以碱基对数量衡量的实际物理距离。 虽然物理图谱可以更准确地表示基因组,但遗传图谱通常可以深入了解染色体不同区域的性质,例如 遗传距离与物理距离的比率在不同的基因组区域变化很大,这反映了不同的重组率,并且这种比率通常表示基因组的常染色质(通常是基因丰富)与异染色质(通常是基因贫乏)区域。
基因
研究人员通过从携带显着疾病或特征的家庭成员和不携带显着疾病或特征的家庭成员那里收集血液、唾液或组织样本来绘制基因图谱。 基因作图,尤其是个人基因组测试中最常用的样本是唾液。 然后,科学家从样本中分离出 DNA 并仔细检查,寻找确实携带这种疾病的家庭成员的 DNA 中的独特模式,以及那些未携带这种疾病的人的 DNA 中没有的独特模式。 DNA 中这些独特的分子模式被称为多态性或标记。
构建遗传图谱的xxx步是开发遗传标记和绘制种群。 两个标记在染色体上的距离越近,它们就越有可能一起传递给下一代。 因此,所有标记的共分离模式可用于重建它们的顺序。 考虑到这一点,每个遗传标记的基因型都会为父母双方和后代的每个人记录下来。 遗传图谱的质量在很大程度上取决于这些因素:图谱上遗传标记的数量和作图种群的规模。 这两个因素是相互关联的,因为更大的绘图人口可以增加地图的分辨率并防止地图饱和。
在基因作图中,任何能够忠实地区分两个亲本的序列特征都可以作为遗传标记。 在这方面,基因表现为可以在两个父母之间忠实地区分的特征。 它们与其他遗传标记的联系以相同的方式计算,就好像它们是共同标记一样,然后将实际基因位点括在两个最近的相邻标记之间的区域中。 然后通过查看更多以该区域为目标的标记来重复整个过程,以将基因邻域映射到更高分辨率,直到可以识别特定的致病基因座。 这个过程通常被称为定位克隆,广泛用于植物物种的研究。 一种植物物种,特别是利用定位克隆的植物物种是玉米。 遗传图谱的xxx优势在于它可以仅根据表型效应识别基因的相对位置。
遗传作图是一种准确识别哪个染色体具有哪个基因并精确定位该基因在该特定染色体上的位置的方法。 作图也是一种根据两个基因之间的距离确定哪个基因最有可能重组的方法。 两个基因之间的距离以称为厘摩或地图单位的单位测量,这些术语可以互换。 厘摩是基因之间的距离,其中一百个减数分裂产物中有一个是重组的。 两个基因彼此越远,它们重组的可能性就越大。 如果距离更近,则会发生相反的情况。
物理映射
由于实际的碱基对距离通常很难或不可能直接测量,因此物理图谱实际上是通过首先将基因组打散成层次更小的片段来构建的。 通过表征每个单片并重新组合在一起,这些小片段的重叠路径或平铺路径将使研究人员能够推断出基因组特征之间的物理距离。 基因组的片段化可以通过限制酶切割或通过超声处理等过程物理破碎基因组来实现。 切割后,通过电泳分离 DNA 片段。
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