磷脂脂肪酸
编辑磷脂脂肪 (PLFAs) 作为细菌和其他生物的化学分类学标记广泛应用于微生物生态学。 磷脂是构成细胞膜的主要脂质。 磷脂可以皂化,从而释放出甘油二酯尾部所含的脂肪酸。 一旦未知样品的磷脂被皂化,所得 PLFA 的组成就可以与已知生物体的 PLFA 进行比较,以确定样品生物体的身份。 PLFA 分析可以与其他技术相结合,例如稳定同位素探测以确定样品中哪些微生物具有代谢活性。 PLFA 分析由田纳西大学的 D.C. White 在 80 年代初期至中期率先提出。
磷脂脂肪酸分析
编辑PLFA 是所有微生物细胞膜的重要结构成分。 PLFA 分析是一种广泛用于估计总生物量和观察土壤和水环境中活微生物群落群落组成的广泛变化的技术。 近年来,人们对 PLFA 的兴趣激增,从关于该主题的同行评审期刊参考文献的大量增加可以看出。 然而,人们越来越担心一些研究人员将 PLFA 归入特定的微生物类别,而实际上这些 PLFA 存在于广泛的生命形式中。 磷脂可以存在于许多生物类别中(例如植物根部、真菌以及土壤细菌),因此必须小心将 PLFA 生物标志物过度分配给错误的类别。 尽管磷脂存在于许多不同的生命形式中,但不同生命形式之间的脂肪酸侧链可能非常独特。 多不饱和脂肪酸(例如 18:3 ω3c)存在于植物、藻类和蓝细菌中,但通常不存在于细菌中。 单不饱和脂肪酸(特别是在 omega-7 位置)、奇数链饱和脂肪酸(例如 15:0)、支链脂肪酸(主要是异或非异和 10-甲基)和环丙烷脂肪酸(例如 19:0 环ω7c)主要由细菌合成。 多不饱和脂肪酸 18:2 ω6c(亚油酸)存在于土壤真菌中,而单不饱和脂肪酸 16:1 ω5c 主要存在于丛枝菌根真菌 (AMF) 中。
基本前提是随着个体生物体(尤其是细菌和真菌)的死亡,磷脂会迅速降解,样品中剩余的磷脂含量被假定为来自活生物体。 由于不同细菌和真菌类群的磷脂含有各种不同寻常的脂肪酸,它们可以作为这些类群的有用生物标志物。 PLFA 概况和组成可以通过纯化磷脂然后裂解脂肪酸进行进一步分析来确定。 了解土壤、水和废物中微生物群的组成和代谢活动有助于优化作物生产、生物修复和了解微生物生态系统。 由于对土壤微生物群的主要部分进行灵敏、可重复的测量,并且 PLFA 不需要培养有机体,因此通过 PLFA 进行的土壤微生物群落分析已成为一种广泛使用的技术。 通过培养对土壤种群进行取样已证明不具有成本效益,并且由于某些生物体的培养难易程度不同而导致结果有偏差。 PLFA 的主要缺点是提取时间非常长且繁琐。 开发了一种新的 96 孔板 PLFA 提取程序,与传统的 PLFA 提取方法相比,吞吐量增加了 4 到 5 倍。 这种新方法与用于分析 PLFA 数据的新软件工具相结合,将对进行大量 PLFA 分析的实验室或希望开始 PLFA 研究的实验室有用。
磷脂脂肪酸生物标志物(常见情况)
- 饱和脂肪酸 (SAFA)
• 15:0(十五烷酸)– 细菌 • 其他直链(例如 16:0,棕榈酸)– 原核生物和真核生物 • 异支链(例如 17:0 异,15-甲基棕榈酸)– 革兰氏阳性菌 • 反异 -支链(例如 17:0 反异、14-甲基棕榈酸)– 革兰氏阳性菌 • 10-甲基支链(例如 19:0 10-甲基、结核硬脂酸)– 放线菌
- 单不饱和脂肪酸 (MUFA)
• 16:1 ω5c(11-十六碳烯酸)- 丛枝菌根真菌 (AMF)、菌丝(使用 NLFA 分析在中性脂质部分中发现了 AMF 孢子)• Omega-5 和 7 位(例如 16:1 ω7c、棕榈油酸 ) – 革兰氏阴性菌• 16:1 ω8c(8-十六碳烯酸)- I 型甲烷氧化细菌• 18:1 ω8c(10-十八碳烯酸)- II 型甲烷氧化细菌• Omega-9 位(例如 16 :1 ω9c, cis-7-Palmitoleic acid) - Fungi & 革兰氏阳性菌
- 多不饱和脂肪酸 (PUFA)
• 18:2 ω6c,(亚油酸)– 真菌 • 20:2 ω6c、20:3 ω6c、20:4 ω6c -
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