质粒
编辑质粒 e 是小的,通常是环形的,自主复制的双链 DNA 分子,可以存在于细菌和古细菌中,但不是细菌染色体的一部分(核等价物),即它们存在于染色体外。 因此,它们也被称为染色体外元件 (ECE)。 质粒 e 也很少出现在真核生物中(例如面包酵母中的 2 微米环)。 它们的大小通常在 2 kbp 和 200 kbp 之间,在特殊情况下小于 1 kbp(小质粒)和超过 1000 kbp(大质粒),大质粒和小染色体之间的过渡是流动的。 古细菌中类似的染色体外 DNA 是 Borgs。
结构
编辑质粒e可以包含许多不同的基因。 介导这些基因 z。 B. 抗生素抗性,这可以导致宿主细菌的选择性优势。 每个质粒至少包含一个作为复制起点(ORI)的序列。 如果复制起点与细菌菌株相容,则质粒可以独立于染色体 DNA 进行复制。 质粒因此自主复制(复制子)并被继承。 根据复制起点的性质,细菌细胞中有很少或非常多的拷贝(高拷贝)。
在细菌中,附加体是质粒e,它可以整合到宿主生物体的染色体DNA中。 它们可以在那里停留很长时间,随着宿主细胞的每次分裂而复制,甚至成为宿主 DNA 的组成部分。 然而,它们也可以像其他质粒一样单独存在。
真核生物中偶尔出现的病毒附加体,如乙型肝炎病毒的cccDNA或疱疹病毒、腺病毒的附加体,不整合到宿主的基因组中,但也存在于细胞核中。 一个例外是痘病毒的附加体,它出现在胞质溶胶中。 病毒附加体是免疫逃避持久性病原体感染的机制。
分类
编辑质粒en有两个基本组,共轭和非共轭。 结合质粒含有所谓的 tra 基因,它可以触发结合,即两种细菌之间质粒的顺性交换。 非共轭质粒没有这种能力,但在共轭过程中可以随着共轭质粒一起传播。
不同的质粒类型可以共存于同一个细胞中,例如在大肠杆菌中。 B. 最多七个。 如果两个质粒互不相容,其中一个就会被摧毁。 因此,根据在同一细胞中共存的能力,它们可以分为不相容组。
一种特殊类型的质粒是所谓的 Ti-质粒(肿瘤诱导),它传输转移 DNA。 它们通常是某些细菌的组成部分,并被它们转移到植物中。 在那里,它们会导致植物中xxx已知的癌症。
IncP1 类型的质粒可以从细菌转移到所有三个域的生物体。
使用
编辑质粒是分子生物学、遗传学、生物化学以及其他生物和医学领域的重要工具。 它们在基因工程中被称为载体,用于复制或表达基因。 向量的有针对性的调整称为向量设计。
它们源自天然存在的质粒en,并且仍然具有它们的结构成分,例如复制起点。 此外,它们经过修饰,可以轻松用于克隆:将要复制的基因插入质粒e中,质粒e具有抗生素抗性基因。 然后将这些质粒引入细菌中,细菌在经过适当抗生素处理的营养培养基上生长。 只有吸收了具有抗生素抗性信息质粒的细菌才能存活。 未吸收质粒的细菌被抗生素杀死。 抗生素作为一种选择标记,只允许带有抗性质粒的细菌存活。 将基因插入质粒通常会打断另一个基因(报告基因),该基因将无法再表达。 这种缺失的特性可以用于筛选,因为只有那些吸收了所需基因的质粒的细菌不再具有这种特性。可大量获得相应的基因产物。 该程序现在允许生产重组胰岛素(即与人胰岛素相同的胰岛素),以前必须在费力的过程中从猪的胰腺中分离出来。
如果要将一段DNA导入生物体(细菌、植物、动物、人等),质粒e也可以作为载体(载体)。 在动物和人类中,这种方法仅适用于细胞培养中的细胞,因为细胞很容易以单层形式存在。 根据靶细胞的类型,转移需要沉淀的 DNA(例如,通过内吞作用摄取质粒来修饰肌肉细胞)或脂质体中包装的 DNA。 还有许多其他方法,例如电穿孔、基因枪、DNA 小环、病毒载体等等。 可进一步提高目标细胞的转染效率(真核生物)或转化效率(原核生物)。
可视化
编辑使用合适的方法,例如用铀原子染色(BAC 扩散),可以使质粒 e 在电子显微镜下可见。 以 DNA 形式缠绕自身的质粒环状结构具有拓扑后果。 质粒e可以以三种不同的形状存在。 超螺旋形状是质粒的自然构象。 由于 DNA 双螺旋结构自身扭曲,无法在封闭的质粒中展开自身,因此产生了扭转应力,导致质粒在空间中围绕自身弯曲。 同样的效果可以用电话线观察到,电话线绕着自己的轴扭曲。 在开链形式中,两条 DNA 链中的一条在一点断裂(所谓的缺口),这意味着开链可以围绕固定链自由旋转; 这使扭应力松弛,质粒打开。 在线性 DNA 的情况下,两条链都断裂并且环状结构被废除。
染色体差异
编辑质粒en和染色体之间的区别并不容易。 一种定义指出质粒 e 比染色体小。 然而,z。 例如,苜蓿中华根瘤菌的质粒 pSymB 是肺炎支原体初级基因组的两倍大。 另一个定义是质粒e不携带必需基因。 然而,什么是“必需基因”取决于生存环境。 另一个定义指出,质粒 e 在细胞中的拷贝数多于染色体。 然而,像大肠杆菌和许多其他大肠杆菌中的 F-质粒这样的质粒存在的拷贝数与染色体相同。 染色体的一个重要特征是它的复制与细胞周期协调。
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