二磷酸腺苷核糖基化
编辑二氧化硫醇核糖基化是在蛋白质中添加一个或多个 ADP-核糖基团。 它是一种可逆的翻译后修饰,参与许多细胞过程,包括细胞信号转导、DNA 修复、基因调控和细胞凋亡。不当的二氧化硫醇糖基化与某些形式的癌症有关。 它也是霍乱毒素、白喉毒素等细菌化合物毒性的基础。
历史
编辑20 世纪 60 年代初期,xxx个提出二氧化硫辛酸碱糖基化的建议浮出水面。 此时,Pierre Chambon 及其同事观察到 ATP 掺入母鸡肝核提取物中。 在对酸不溶性部分进行广泛研究后,几个不同的研究实验室能够将源自 NAD+ 的 ADP-核糖确定为合并基团。 几年后,负责这种掺入的酶被鉴定并命名为聚(ADP-核糖)聚合酶。 最初,该组被认为是通过核糖糖苷键共价键合的 ADP-核糖单元的线性序列。 后来有报道称,每 20 到 30 个 ADP 残基就会发生分支。
单(ADP-核糖基)化的首次出现发生在一年后的一项毒素研究中:白喉棒状杆菌白喉毒素被证明依赖于 NAD+ 以使其完全有效,从而导致发现酶促结合 单(ADP-核糖基)转移酶的单个 ADP-核糖基团。
最初认为,二氧化酸醇核糖基化是一种仅涉及基因调控的翻译后修饰。 然而,随着更多具有 ADP-核糖基化蛋白质能力的酶被发现,二氧化酸胡萝卜糖基化的多功能性质变得明显。 xxx种具有聚(ADP-核糖)转移酶活性的哺乳动物酶是在 80 年代后期发现的。 在接下来的 15 年里,它被认为是xxx能够在哺乳动物细胞中添加 ADP 核糖链的酶。 在 20 世纪 80 年代后期,人们发现了 ADP-核糖基环化酶,它可以催化将环状 ADP 核糖基团添加到蛋白质中。 最后,sirtuins 是一类具有 NAD+ 依赖性脱酰活性的酶,被发现也具有单 (ADP-核糖基) 转移酶活性。
催化机理
编辑大多数进行这种修饰的酶的 ADP-核糖来源是氧化还原辅助因子 NAD+。 在此转移反应中,连接 ADP-核糖分子和烟酰胺基团的 NAD+ 的 N-糖苷键被裂解,随后目标氨基酸侧链发生亲核攻击。 (ADP-核糖基)转移酶可以进行两种类型的修饰:单(ADP-核糖基)化和聚(ADP-核糖基)化。
单(ADP-核糖基)化
单 (ADP-核糖基) 转移酶通常使用酶的高度保守的 R-S-EXE 基序催化 ADP-核糖添加到精氨酸侧链。 反应通过打断烟酰胺和核糖之间的键形成氧鎓离子来进行。 接下来,目标蛋白的精氨酸侧链充当亲核试剂,攻击与氧鎓离子相邻的亲电子碳。 为了使该步骤发生,精氨酸亲核试剂被催化酶上的谷氨酸残基去质子化。 另一个保守的谷氨酸残基与核糖链上的一个羟基形成氢键,以进一步促进这种亲核攻击。 作为裂解反应的结果,烟酰胺被释放。 这种修饰可以被 (ADP-核糖基) 水解酶逆转,水解酶切割精氨酸和核糖之间的 N-糖苷键,释放出 ADP-核糖和未修饰的蛋白质; NAD+ 不会通过逆反应恢复。
聚(ADP-核糖基)化
聚(ADP-核糖)聚合酶 (PARP) 主要存在于真核生物中,可催化多个 ADP-核糖分子向靶蛋白的转移。 与单(ADP-核糖基)化一样,ADP-核糖的来源是 NAD+。 PARP 使用 His-Tyr-Glu 的催化三联体来促进 NAD+ 的结合以及将现有聚(ADP-核糖)链的末端定位到目标蛋白上; Glu 促进两个核糖分子之间催化和形成 (1''→2') O-糖苷键。
还有其他几种酶可以识别聚 (ADP-核糖) 链、水解它们或形成分支; 超过 800 种蛋白质被注释为包含松散定义的聚(ADP-核糖)结合基序; 因此,除了这种改变靶蛋白构象和结构的修饰外,它还可以用作标签来招募其他蛋白质或用于调节靶蛋白。
氨基酸特异性
编辑许多不同的氨基酸侧链被描述为 ADP-核糖受体。 从化学角度来看,这种修饰代表蛋白质糖基化:ADP-核糖转移到具有亲核氧、氮或硫的氨基酸侧链上,导致与核糖的 N-、O- 或 S-糖苷键连接 ADP-核糖。
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